復發(fā)性口腔潰瘍首先與免疫有著很密切的關系。有的患者表現(xiàn)為免疫缺陷，有的患者則表現(xiàn)為自身免疫反應，也就是由于各種因素，使人體正常的免疫系統(tǒng)，對自身組織抗原，產生免疫反映，而引起組織的破壞而發(fā)病。

其次是與遺傳有關系，在臨床中，復發(fā)性口腔潰瘍的發(fā)病，有明顯的家族遺傳傾向，我們常常看到，父母一方或多方若患有復發(fā)性口腔潰瘍，那么，他們的子女就比一般人更容易患病。

另外，復發(fā)性口腔潰瘍的發(fā)作，常常還與一些疾病或癥狀有關，比如消化系統(tǒng)疾病胃潰瘍，十二指腸潰瘍，慢性或遷延性肝炎，結腸炎等，另外貧血，偏食，消化不良，腹瀉，發(fā)熱，睡眠不足，過度疲勞，精神緊張，工作壓力大、月經周期的改變等等。隨著一種或多種因素的活躍、交替、重疊就出現(xiàn)機體免疫力下降，免疫功能紊亂，也就造成了復發(fā)性口腔潰瘍的頻繁發(fā)作。