由于宮腔內(nèi)人工授精需要把精子注入子宮腔，有并發(fā)生殖道感染的可能。國外已有宮腔內(nèi)人工授精合并盆腔感染的報(bào)告，但發(fā)生率低。另外，由于宮腔內(nèi)人工授精常采用促排卵治療，有發(fā)生卵巢過度刺激綜合征的可能，其中嚴(yán)重過度刺激綜合征發(fā)生率約為1%，可通過B超監(jiān)測(cè)卵泡發(fā)育進(jìn)行監(jiān)測(cè)。多胎妊娠與流產(chǎn)也是其合并癥之一。專家表示，人工授精無論是AID還是AIH，雖然操作并不復(fù)雜，但都不是絕對(duì)安全的，稍不注意即有引起種種并發(fā)癥的可能。常見的并發(fā)癥有：

1、感染

主要與操作人員的無菌觀念不強(qiáng)，以及精液中無法保持絕對(duì)無菌有關(guān)。有因人工授精引起附件炎和盆腔炎的報(bào)道。人工授精后應(yīng)用適當(dāng)?shù)目股赜幸欢A(yù)防作用。

2、出血和損傷

主要與操作方法欠當(dāng)，使用的器械不當(dāng)（過于簡陋）和操作粗暴、不熟練有關(guān)。

3、下腹部疼痛

多因精液注入速度過快、壓力過多以致發(fā)生子宮痙攣性收縮而疼痛。若做子宮腔內(nèi)授精，如注入的精液過多，精液可經(jīng)輸卵管流入腹腔，引起刺激性下腹痛。

4、誘發(fā)子宮內(nèi)膜異位癥

這個(gè)比較少見，多因?qū)m腔內(nèi)授精注入精液過快過多、壓力過高所致。

5、潛在的醫(yī)學(xué)倫理學(xué)、遺傳學(xué)危險(xiǎn)

在AID中，當(dāng)一份供精者的精液為兩名以上婦女授精后，這些婦女所生的子女從血緣關(guān)系上將屬于同父異母的兄弟姐妹。由于AID的保密性，這些同父異母的子代是不能也無法相互認(rèn)識(shí)的。他們成年后萬一恰巧成婚，即將造成血緣婚姻，可能會(huì)產(chǎn)生對(duì)下一代的遺傳性危害，盡管這種巧合發(fā)生的帆會(huì)很少。