1、腹腔鏡：可對卵巢囊腫的形態(tài)結(jié)構(gòu)、囊腫與周圍臟器的關(guān)系有一個直觀的判斷。并在可疑部位進行多點活檢，抽吸腹腔液進行細胞學檢查（在腹腔液中檢查是否有脫落的癌細胞）。

2、B超：對于卵巢囊腫的診斷，B超無疑是最簡便易行的診斷方法。首先B超檢查最好避開排卵期，前面提到大多數(shù)生理性囊腫和月經(jīng)周期有關(guān)，所以在月經(jīng)干凈一周內(nèi)檢查，可以更好地判斷是生理性囊腫還是病理性囊腫。其次，B超不但可以看到卵巢囊腫所在的位置、形態(tài)與大小，還能判斷囊腫內(nèi)部的成分。一般囊腫內(nèi)部是液體成分，如果出現(xiàn)實體成分或顯示血流豐富，就要懷疑是否為惡性囊腫，需要進一步確診。

3、CT、核磁：相比B超，CT與核磁能更為清晰地觀察卵巢囊腫的形態(tài)，和是否有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移。良性的囊腫，多數(shù)邊界清晰、光滑，一般沒有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移；而惡性腫瘤多數(shù)輪廓不規(guī)則，和周圍組織糾纏不清，或伴有腹水，還可能有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移。

4、腫瘤標志物：雖然目前還沒有一種惡性卵巢囊腫專有的標志物，但如CA125、AFP199以及甲肽蛋白AFP等，對判斷卵巢囊腫的良惡性還是有一定指導作用的——如果是惡性囊腫，這些指標值會顯著升高。

5、病理活檢：病理活檢就是將切下的卵巢囊腫組織制成超薄的切片，放在顯微鏡下仔細觀察，從而得知這部分組織到底發(fā)生了什么樣的變化。