1、疼痛：70%～80%的內異癥患者均有不同程度的盆腔疼痛，與病變程度不完全平行，包括痛經（典型者為繼發(fā)性痛經，并漸進性加重）、非經期腹痛（慢性盆腔痛，chronic pelvic pain，CPP）、性交痛以及排便痛等；卵巢內異癥囊腫破裂可引起急性腹痛。

2、不孕：約50%的內異癥患者合并不孕。

3、月經異常。

4、盆腔包塊。特殊部位的內異癥則表現(xiàn)為各種癥狀并常伴有周期性變化，也可合并盆腔內異癥的臨床表現(xiàn)：

（1）消化道內異癥：大便次數(shù)增多或便秘、便血、排便痛等。

（2）泌尿道內異癥：尿頻、尿痛、血尿及腰痛，甚至造成泌尿系統(tǒng)梗阻及腎功能障礙。

（3）呼吸道內異癥：經期咯血及氣胸。

（4）瘢痕內異癥：剖宮產等手術后腹壁切口瘢痕處結節(jié)，經期增大，疼痛加重；會陰切口或切口瘢痕結節(jié)，經期增大，疼痛加重。