手術治療包括根治手術和保守手術。根治手術即為子宮切除術，保守手術包括腺肌病病灶（腺肌瘤）切除術、子宮內膜及肌層切除術、子宮肌層電凝術、子宮動脈阻斷術以及骶前神經(jīng)切除術和骶骨神經(jīng)切除術等。子宮切除術適用于患者無生育要求，且病變廣泛，癥狀嚴重，保守治療無效。而且，為避免殘留病灶，以全子宮切除為首選，一般不主張部分子宮切除。

子宮腺肌病病灶切除術適用于有生育要求或年輕的患者。因為子宮腺肌病往往病灶彌漫并且與子宮正常肌肉組織界限不清，因此如何選擇切除的方式以減少出血、殘留并利于術后妊娠是一個很困惑的問題。不同學者有不同的方案，目前并沒有一個統(tǒng)一的術式。

腹腔鏡下子宮病灶做橫H形切口，可減少切除病灶時穿透宮腔的風險，將包繞病灶的肌層折疊縫合。開腹行子宮肌層U型切除。選擇宮體中央縱形切除，術后未用輔助治療，術后3個月可妊娠。近年來，隨著介入治療技術的不斷進步。選擇性子宮動脈栓塞術也可以作為治療子宮腺肌病的方案之一。但是部分學者認為子宮動脈栓塞術會影響子宮及卵巢的血運，從而對妊娠有不利影響。可能會導致不孕、流產(chǎn)、早產(chǎn)并增加剖宮產(chǎn)率。