一、保守治療：保守治療多采用假孕或假絕經(jīng)療法，如達(dá)哪唑和三苯氧胺（三苯氧胺【譯】：是目前最常見(jiàn)的抗雌激素藥物，是乳腺癌內(nèi)分泌治療中最常用的藥物，已被廣泛應(yīng)用于臨床。）、內(nèi)美通、普維拉等，人為的造成月經(jīng)停止來(lái)潮形成假孕狀態(tài)，不來(lái)月經(jīng)就沒(méi)有痛經(jīng)；但副作用較大，并對(duì)肝腎有一定的損害，不建議采用。

二、手術(shù)治療：保守治療無(wú)效時(shí)，說(shuō)明患者子宮內(nèi)膜異位癥狀已經(jīng)比較嚴(yán)重，需考慮手術(shù)治療。手術(shù)治療有保守性、根治性和半保守性三種：

1、保守性手術(shù)：主要用于年輕、有生育要求者。保留子宮及附件（盡量保留雙側(cè)），只是切除病灶、分離粘連、重建卵巢、修復(fù)組織。近年來(lái)應(yīng)用顯微外科手術(shù)，切除異位病灶，仔細(xì)縫合創(chuàng)面、重建盆腔腹膜，仔細(xì)止血，徹底沖洗，使手術(shù)效果臻于完善，提高手術(shù)后妊娠成功率，降低復(fù)發(fā)率。

2、半根治手術(shù)：無(wú) 生育要求，病灶嚴(yán)重，而年齡較輕者（即小于45歲），可行子宮和病灶全切，但盡可能保留一側(cè)正常的卵巢組織，以避免絕經(jīng)期癥狀過(guò)早出現(xiàn)。切除子宮可去除具有活力的子宮內(nèi)膜細(xì)胞種植的來(lái)源，從而可減少?gòu)?fù)發(fā)機(jī)會(huì)，但因保留了卵巢仍有可能復(fù)發(fā)。一般認(rèn)為半根治術(shù)后復(fù)發(fā)率低，后遺癥少。

3、根治性手術(shù)：年齡接近絕經(jīng)期，尤其病情重，有過(guò)復(fù)發(fā)者，應(yīng)實(shí)行全子宮及雙側(cè)附件切除。手術(shù)時(shí)盡可能避免卵巢內(nèi)膜囊腫破裂，囊液流出時(shí)應(yīng)盡快吸盡、沖洗。術(shù)后出現(xiàn)更年期綜合征者，可用鎮(zhèn)靜劑及尼爾雌醇。