丙型肝炎是以肝細胞損傷為主的疾病，肝細胞破壞的機制有兩種可能件：

（1）內(nèi)肝病毒直接破壞肝細胞。由于采用聚合酶鏈反應和原位雜交檢測均顯示血清及肝臟內(nèi)肝病毒核糖核酸的變化與轉(zhuǎn)氨酶異常變化相平行，故認為病毒在復制過程中可能直接損傷肝細胞的細胞器。促使肝細胞膜對轉(zhuǎn)氨酶的通透性增強。丙肝病毒抗原肝細胞可見胞漿明顯疏松水腫、小空泡性脂肪變性及氣球樣變，亦提示丙肝病毒具有直接破壞肝細胞的作用。

（2）較多實驗證明免疫因素也是肝細胞損傷的主要原因，尤其是細胞免疫可能是丙肝病毒導致肝細胞損傷的重要因素。