關(guān)于甲型肝炎的發(fā)病機制研究較少，尚未完全闡明。經(jīng)口感染HAV后，發(fā)病前有短暫病毒血癥階段，然后再定位于肝臟。

既往認為HAV對肝細胞有直接損害作用。近年研究表明：實驗感染HAV的動物肝細胞及HAV體外細胞培養(yǎng)時均不發(fā)生細胞病變；患者血清CD+8細胞亞群增高，致敏淋巴細胞對HAV感染的肝細胞顯示細胞中毒性；肝內(nèi)炎癥反應(yīng)明顯等。

根據(jù)研究結(jié)果，目前認為，其發(fā)病機制傾向于以宿主免疫反應(yīng)為主。發(fā)病早期，可能由于HAV在肝細胞中大量增殖及CD+8細胞毒性T細胞殺傷作用共同造成肝細胞損害，病后期可能以免疫病理損害為主。