氯喹與羥氯喹在化學結構、藥理作用、適應證、不良反應以及藥物代謝等方面存在差異。

1. 化學結構：氯喹的化學結構相對簡單，羥氯喹是氯喹的一種衍生物，其分子結構經過了一定的修飾。

2. 藥理作用：氯喹主要通過干擾瘧原蟲的代謝過程發(fā)揮抗瘧作用，同時對自身免疫性疾病有一定療效。羥氯喹的作用機制與氯喹相似，但在免疫調節(jié)方面可能具有一些獨特的特點。

3. 適應證：氯喹常用于治療瘧疾，也可用于治療某些自身免疫性疾病，如紅斑狼瘡。羥氯喹則更常用于類風濕關節(jié)炎、系統(tǒng)性紅斑狼瘡等自身免疫病的治療。

4. 不良反應：氯喹可能導致視力損害、心臟毒性等不良反應，發(fā)生率相對較高。羥氯喹的不良反應相對較少且較輕，常見的有胃腸道不適、皮疹等，但長期使用也可能影響視網膜。

5. 藥物代謝：兩者在體內的代謝過程有所不同，氯喹的代謝速度相對較快，羥氯喹的代謝則相對較慢。

總之，氯喹和羥氯喹雖然有相似之處，但在多個方面存在區(qū)別。在臨床應用中，醫(yī)生會根據患者的具體病情、身體狀況等因素綜合考慮，選擇合適的藥物進行治療。患者應嚴格遵醫(yī)囑用藥，不可自行增減藥量或換藥。