月經干凈第二天同房存在懷孕風險，主要與月經周期不規(guī)律、排卵提前、額外排卵、精子存活時間長、黃體功能異常等因素有關。

1. 月經周期不規(guī)律：女性的月經周期受多種因素影響，如情緒、壓力、環(huán)境變化等。若月經周期不規(guī)律，排卵時間也難以準確預測。月經干凈第二天看似處于安全期，但可能因周期紊亂，排卵提前，此時同房就有懷孕的可能。

2. 排卵提前：正常情況下，女性的排卵日一般在下次月經來潮前14天左右。然而，個體差異以及外界因素干擾，可能導致排卵提前。若恰好在月經干凈第二天排卵，同房后精子與卵子結合，就會受孕。

3. 額外排卵：在某些特殊情況下，女性可能會出現額外排卵。比如受到強烈的情緒刺激、生活環(huán)境突然改變等，都可能促使卵巢在非預期的時間排出卵子。即使月經剛結束，也可能發(fā)生額外排卵，增加懷孕幾率。

4. 精子存活時間長：精子在女性生殖道內具有一定的存活時間，通?？梢源婊? - 3天，個別情況下甚至能存活5天。如果月經干凈第二天同房，精子進入女性體內并存活，而隨后女性提前排卵，就可能形成受精卵，導致懷孕。

5. 黃體功能異常：黃體功能對女性的月經周期和排卵有重要影響。若黃體功能異常，可能導致月經周期縮短、排卵時間改變。月經干凈第二天可能已經接近新的排卵周期，此時同房就存在懷孕風險。

月經干凈第二天同房并非絕對安全，存在多種導致懷孕的因素。女性不能單純依靠安全期來避孕，應采取科學有效的避孕措施，如使用避孕套、口服短效避孕藥等。若對自身的生殖健康有疑問或出現異常情況，建議及時到正規(guī)醫(yī)院婦產科或生殖健康科就診咨詢。