口腔潰瘍的復發(fā)病因目前尚不十分明確，但有很多因素可以直接導致口腔潰瘍的發(fā)生：口腔潰瘍的種類如細菌、病毒等微生物的感染；營養(yǎng)不良、維生素缺乏；消化系統(tǒng)疾病如腸胃潰瘍炎癥、便秘、腹瀉等的影響；微量元素缺乏，如缺鐵、葉酸、B12以及鋅等；內分泌失調；精神、神經(jīng)因素，如工作勞累、精神緊張波動、神經(jīng)功能紊亂失調等。

而口腔潰瘍的病因不明，部分患者發(fā)病原因同緊張、外傷、戒煙、月經(jīng)、食物過敏有關?？谇粷兊姆N類無特殊檢查法，只能依賴典型癥狀和疾病史診斷。但決不能因此而忽視鑒別診斷。應想到除鐵、葉酸、VitB12不足外，還應考慮有無慢性炎癥性腸病、艾滋病感染、中性粒細胞減少等免疫障礙?？谇粷?yōu)槭裁蠢鲜欠捶磸蛷桶l(fā)作？另外，還應除外白血病、紅斑性狼瘡、Behcet?。ㄒ妶D）等全身性疾病和皮膚病。抗癌藥和抗甲狀腺藥也可能產(chǎn)生口腔潰瘍。

此外，口腔潰瘍疾病有些女性每逢經(jīng)期或行經(jīng)前后就會出現(xiàn)，用藥治療只能暫時緩解，下月行經(jīng)時依然如故地出現(xiàn)，疼痛難忍，與此同時，還常伴有口干、心煩、易怒和大便干結等令人煩惱的癥狀。臨床研究發(fā)現(xiàn)，月經(jīng)期出現(xiàn)口腔潰瘍主要是由于體內黃體酮水平增高而雌激素（孕酮等）的水平降低所致。

另外，復發(fā)性口腔潰瘍，呈圓或橢圓形，境界清晰。80%的患者潰瘍直徑在5mm以下，歷時7～14日而愈，較大的潰瘍少見，而且需數(shù)周或數(shù)月治愈，且殘留瘢痕。另外，還有分類為皰疹性潰瘍，則需1個月治愈。而單發(fā)的慢性潰瘍應懷疑口腔癌。小兒周期性發(fā)熱、咽炎、手足口病和傳染性單核細胞增多癥時，口腔潰瘍也可作為伴隨癥狀出現(xiàn)，因此建議患者一定要慎重對待。