濕疣病毒只能生存于皮膚表面和黏膜，理論上說清除是比較容易的。只要將疣體、亞臨床感染病毒、潛伏病毒全部徹底清除，就能保證濕疣不復發(fā)。但是用傳統(tǒng)的物理方法和腐蝕性藥物 徹底清除濕疣病毒并不是很容易的，這便是造成此病反復發(fā)作的原因。

1、患病部位的特殊性使得治療時有“投鼠忌器”的感覺。治療過度，輕則留下傷疤、重則造成傷害，治療不足就會復發(fā)；陰道、尿道、宮頸、肛門等敏感部位操作不方便，治療很難到位。

2、亞臨床感染和潛伏病毒不能清除。因顧及安全性治療時很難對亞臨床感染和潛伏病毒區(qū)域同步治療。

3、缺乏有效的鞏固和預防手段。去除疣體后對可能存在的殘留疣體和病毒不能繼續(xù)清除，會導致復發(fā)；此時皮膚很嫩，抗感染能力脆弱，特別容受受到再次感染，會增加再次感染的可能。安全性不夠、不能大面積使用是物理方法和腐蝕性藥物治療濕疣的根本缺陷，也是醫(yī)療界一直難以突破濕疣復發(fā)治療難題的最大障礙。

因尖銳濕疣傳染性強，極易傳染給性伴侶，所以凡患該病的患者，除自己及時治療外，應同時攜帶性伴侶作早期檢測治療，避免造成交叉感染。