肉芽腫性前列腺炎的發(fā)病與局部強烈的異物反應(yīng)有關(guān)。前列腺導(dǎo)管阻塞是首要因素，原因包括細(xì)菌感染引發(fā)的炎癥過程或外科創(chuàng)傷造成的組織壞死，前列腺增生也可能造成或加重前列腺導(dǎo)管的梗阻。感染和炎癥破壞導(dǎo)管和腺體上皮，細(xì)胞碎片、細(xì)菌毒素和前列腺分泌物進入組織間隙，成為基質(zhì)內(nèi)異物，激發(fā)肉芽腫性炎癥反應(yīng)。肉芽腫性炎癥可能是局限的，也可能累及整個前列腺。炎癥緩解慢，約需2～3個月的時間，局部被纖維結(jié)締組織替代，質(zhì)地發(fā)生變化。專家將肉芽腫性前列腺炎按病因分為4類：

1、非特異性占70%，常繼發(fā)于近期的尿路感染。

2、經(jīng)尿道術(shù)后或針吸活檢后占24%。經(jīng)尿道手術(shù)包括TUR-P和TUR-Bt，半數(shù)在術(shù)后6個月內(nèi)發(fā)病。

3、特異性占3%。病原微生物包括細(xì)菌、結(jié)核菌、布氏桿菌、梅毒螺旋體、病毒及真菌等。其中膀胱腫瘤電切術(shù)后灌注卡介苗并發(fā)肉芽腫性前列腺炎受到廣泛重視，作為膀胱灌注卡介苗的并發(fā)癥其發(fā)病率為0.9%～1.3%，僅次于膀胱炎和發(fā)熱的發(fā)病率。也有人對膀胱灌注卡介苗的患者之前列腺進行病理檢查，發(fā)現(xiàn)本病的發(fā)病率實際上很高（41%～75%）。從開始灌注到發(fā)現(xiàn)本病平均約1年時間（3～25個月）。

4、系統(tǒng)性肉芽腫病占3%，為累及全身多器官的肉芽腫性疾病在前列腺局部的表現(xiàn)，包括過敏性肉芽腫?。–hurg-Strauss綜合征）和Wegener肉芽腫病。前者常與多器官肉芽腫和哮喘有關(guān)，因肉芽腫內(nèi)有明顯嗜酸細(xì)胞浸潤故又稱嗜酸細(xì)胞性肉芽腫性前列腺炎。后者為遺傳性疾病，多合并呼吸道肉芽腫及脈管炎。