原發(fā)性男性性病生殖器皰疹的潛伏期2～7天，原發(fā)危害是1個或多個小而瘙癢的紅丘疹，敏捷成為小水皰，3～5天后可構(gòu)成膿皰，破潰后構(gòu)成潰爛、潰瘍、結(jié)痂，伴有痛苦。皮損單發(fā)或交融，男性好發(fā)于龜頭、冠狀溝、陰莖體或尿道口，常伴有發(fā)熱、頭痛、乏力、肌痛、腹股溝淋巴結(jié)腫大和壓痛。表現(xiàn)繼續(xù) 1～2周，通常3～4周皮損結(jié)痂、愈合。

復發(fā)性男性性病生殖器皰疹多在原發(fā)感染后1～4個月內(nèi)復發(fā)。復發(fā)性生殖器皰疹的臨床表現(xiàn)與原發(fā)性的類似，但表現(xiàn)輕，皮疹規(guī)模小，病程也短，通常在數(shù)日內(nèi)可自愈。復發(fā)前1～2天，部分常有刺癢或燒灼感等前驅(qū)表現(xiàn)。臨床上所見到的復發(fā)性生殖器皰疹病人絕大部分為男性。

直腸肛門皰疹病毒感染發(fā)生在男性同性戀者。病人肛門直腸痛苦，肛門有分泌物，糞便時有里急后重感。