單純痘疹感染的重要特點(diǎn)是皰疹病毒可長期蟄伏于體內(nèi)。其間可因受激惹而反復(fù)發(fā)作。單純皰疹的發(fā)病機(jī)制系因病毒入侵后可長期潛伏在病損部位神經(jīng)支配區(qū)域的神經(jīng)節(jié)內(nèi)，如二叉神經(jīng)節(jié)、迷走神經(jīng)節(jié)、骶神經(jīng)節(jié)等。

潛伏的病毒基因組游離存在于神經(jīng)細(xì)胞內(nèi)，甚至可整合于宿主細(xì)胞染色體上：當(dāng)其受某種因素激惹后即可活化，病毒沿神經(jīng)于下行擴(kuò)散到所主配區(qū)域，表現(xiàn)為皰疹復(fù)發(fā)。

病毒在皮膚黏膜上皮細(xì)胞的基底層及中層增殖。受染細(xì)胞發(fā)生退行性變，核染色質(zhì)固縮，產(chǎn)生特征性的細(xì)胞核內(nèi)嗜酸性包涵體（Cowdry A包涵體）；相鄰受染細(xì)胞的胞膜融合，形成多核巨細(xì)胞；細(xì)胞壞死崩解后形成單房性薄壁水皰，四周可繞以紅暈，局部呈炎癥反應(yīng)。在韌發(fā)性皰疹患者，圍繞水皰周圍Ⅲ現(xiàn)的深屢炎癥反應(yīng)較重，復(fù)發(fā)性皰疹則鞍輕。水皰潰破后表層蛻皮，數(shù)小時(shí)內(nèi)產(chǎn)生淺表性潰瘍。皮膚黏膜部位的皰疹損害多局限，但新生兒及免疫力低下者則可能形成病毒血癥，甚至全身性感染。累及重要臟器。對于皰疹性腦炎或新生兒播散性皰疹患者。其實(shí)質(zhì)器官病灶處的充血反應(yīng)乃至出血性壞死現(xiàn)象比皮膚損害處更為顯著，故病情較嚴(yán)重。