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遺傳代謝病，如遺傳性癲癇、先天性代謝異常(糖原病、低血糖、楓糖尿癥、苯丙酮尿癥、腦脂質(zhì)沉積癥、腦白質(zhì)營養(yǎng)不良)先天性腦結(jié)構(gòu)異常，如巨腦回、灰質(zhì)異位癥、腦穿通畸形、腦血管畸形、神經(jīng)皮膚綜合癥等病癥都有可能使新生兒患上癲癇病，母體在懷孕期間一定要做好護理，盡可能的避免各種母體疾病。

患兒在圍產(chǎn)期腦損傷容易造成小兒癲癇。比如主要是產(chǎn)傷、窒息、顱內(nèi)出血、缺氧、缺血性腦病等所造成的。像細菌性腦膜炎、腦膿腫、病毒性腦炎、霉菌性腦膜炎、腦寄生蟲病、接種后腦炎、傳染后腦炎等所造成的顱內(nèi)感染也會間接的引起小兒癲癇的發(fā)生。此外，腦血管疾病也可能會導(dǎo)致小兒癲癇的發(fā)病。

小兒癲癇的病因主要包括氣候突變，氣候的突然變化會是孩子身體感到不適應(yīng)，由于突然有寒冷或悶熱的侵襲，家長們卻沒有及時為孩子做好準(zhǔn)備而導(dǎo)致癲癇病的發(fā)作。精神刺激也屬于一種小兒癲癇的病因，突發(fā)事件或是情感上的刺激，會給人帶來很大的影響，精神上的刺激直接會影響大腦神經(jīng)元的正常運行，癲癇患者腦中樞神經(jīng)會發(fā)出錯誤信號，最終導(dǎo)致癲癇病的發(fā)作。