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間質(zhì)性膀胱炎患者尿液均正常，感染并非膀胱壁纖維化的主要病因，有學(xué)者認(rèn)為盆腔外科手術(shù)或感染產(chǎn)生的淋巴管梗阻是其病因，而許多患者沒有這樣的病史。亦有學(xué)者提出是由于血栓靜脈炎伴膀胱或骨盆內(nèi)臟器急性感染，或由于精神沖動(dòng)產(chǎn)生長(zhǎng)期小動(dòng)脈的痙攣所致，還可能與內(nèi)分泌因素有關(guān)。目前，大量的證據(jù)認(rèn)為間質(zhì)性膀胱炎是一種自體免疫膠原性疾病。對(duì)肥大細(xì)胞和膀胱表面氨基酸糖甙在間質(zhì)性膀胱炎中的作用受到注意，一些研究人員正著手進(jìn)行這方面的研究。

本病病因迄今仍不十分清楚，有以下假說(shuō)：①血管、淋巴管阻塞，曾設(shè)想膀胱纖維化是由于盆腔手術(shù)或感染引起膀胱壁內(nèi)淋巴管阻塞和引起栓塞性脈管炎或由于血管炎所致持久性小動(dòng)脈痙攣所致，但缺乏足夠的證據(jù)。②感染，曾提出過(guò)細(xì)菌、病毒或真菌感染可能是IC的病因，但還沒有在IC患者中檢出上述3種病原體的報(bào)道。③神經(jīng)體液因素，肥大細(xì)胞在IC病人膀胱固有膜和逼尿肌中增多，寒冷、神經(jīng)肽、藥物、創(chuàng)傷、毒素等可活化肥大細(xì)胞，釋放血管活性物質(zhì)可致敏感覺神經(jīng)元，后者進(jìn)一步通過(guò)釋放神經(jīng)遞質(zhì)或神經(jīng)肽活化肥大細(xì)胞；肥大細(xì)胞也可直接引起血管擴(kuò)張或膀胱黏膜損害引起炎癥。④免疫因素，該病對(duì)皮質(zhì)醇治療反應(yīng)良好，部分病人血中可檢測(cè)到抗膀胱黏膜抗體，不少學(xué)者還發(fā)現(xiàn)對(duì)血管抗原產(chǎn)生的自身免疫性抗體或免疫復(fù)合物沉積在血管壁激活補(bǔ)體系統(tǒng)參與了IC發(fā)病。⑤黏膜通透性，推測(cè)IC是由膀胱上皮的功能不良引起，其通透性增加并使尿液通過(guò)移行上皮漏入到膀胱壁，引起膀胱炎癥。有人證實(shí)IC病人膀胱表層上皮內(nèi)TH蛋白增多，提示黏膜的通透性增加。