1、染色體異常。常見的有男性假兩性畸形、克氏綜合征和XYY綜合征。

2、內分泌疾病。原因是促性腺激素缺乏。常見的有選擇性促性腺功能低下型性機能減退，即Kallmann氏綜合征；選擇性LH缺陷癥和FSH缺陷癥；腎上腺皮質增生癥；高泌乳素血癥等。

3、生殖道感染較為常見。近年來隨著性傳播疾病發(fā)病率的提高，生殖道炎癥如前列腺炎、附睪炎、睪丸炎、尿道炎的發(fā)病率和嚴重程度有所增加，嚴重影響男性的生育能力。

4、輸精管道梗阻。影響精子的輸送。

5、睪丸生精功能異常。常見于隱睪，精索靜脈曲張，毒素、磁場、高熱和外傷等理化因素皆可引起睪丸的生精障礙。

6、精子結構異常和精漿異常。影響精子的運動、獲能和頂體反應等。

7、免疫性不育。男性自身產(chǎn)生的抗精子免疫和女性產(chǎn)生的抗精子同種免疫均可引起男性不育。

8、男性性功能障礙。陽痿、早泄、不射精和逆行射精皆可引起男性不育。