多系統(tǒng)萎縮的預防方法主要是針對可能的病因進行預防。

高發(fā)人群：多系統(tǒng)萎縮（MSA）在50歲以上人群的年發(fā)病率為（3～5）/10萬人，MSA發(fā)病年齡多在中年或老年前期（32-74歲），其中90%在40—64歲，平均發(fā)病年齡 52.5-55歲。

高發(fā)人群的預防：在50歲以上的老人要特別注意做好身體檢查，一旦有如果有出現(xiàn)動作減慢、強直和震顫的表現(xiàn)，要及時就診。

家族遺傳：小部分多系統(tǒng)萎縮患者有家族史，全基因組單核苷酸多態(tài)性關(guān)聯(lián)分析顯示，α-突觸核蛋白基因（SNCA）rs11931074、rs3857059和rs3822086位點多態(tài)性可增加MSA患病風險。

家族遺傳的預防：家族中如果有多系統(tǒng)萎縮的親人的人群要特別注意協(xié)調(diào)障礙和語言異常的表現(xiàn)。

環(huán)境因素：有研究提示從事有機溶劑、塑料單體和添加劑暴露、重金屬接觸、從事農(nóng)業(yè)等工作可能增加多系統(tǒng)萎縮發(fā)病風險。

環(huán)境因素的預防：做好職業(yè)防護，佩戴口罩，手套，防護衣等。不要長時間暴露在危險的環(huán)境中，每年做好體檢。