首先，皮膚病引起的甲病變。如銀屑病皮炎濕疹扁平苔蘚等也可引起甲板增厚變形有凹點(diǎn)或縱嵴等，這些疾病一般同時(shí)有相應(yīng)的皮膚病癥可協(xié)助診斷，避免與灰指甲病混淆。

其次，細(xì)菌感染。綠膿桿菌感染可綠甲而類似青霉菌等霉菌感染后的癥狀也會(huì)與灰指甲病混淆。

細(xì)菌性甲溝炎及其甲病變可與念珠菌引起者相似，但前者均有明顯的紅腫熱痛等急性炎癥，并可出現(xiàn)膿液，這是后者沒有灰指甲病的。

最后，全身性疾病營(yíng)養(yǎng)性疾病遺傳性疾病或藥物可以引起種種甲的改變。而灰指甲病是由外因引起，真菌對(duì)甲板的感染是陸續(xù)傳染的，有時(shí)見到的多個(gè)甲發(fā)生癬癥，但卻先后出現(xiàn)灰指甲病的癥狀，并仍可能有一些指甲完全正常，這在內(nèi)因性甲病中是見不到的。