口服抗真菌藥物是一種有效治療灰指甲的方法，可用于治療灰指甲的抗真菌藥物有灰黃霉素、酮康唑、氟康唑，伊曲康唑和特比萘芬。由于口服灰黃霉索治療灰指甲療程長達一年以上，且療效低，治愈者不足四成，半數(shù)患者會復(fù)發(fā)，因此目前已經(jīng)很少應(yīng)用。

口服酮康唑治療灰指甲，需要連續(xù)服藥1～2個月，中毒性肝炎發(fā)生率很高，死亡病例也不少，因此目前也較少應(yīng)用。氟康唑主要治療系統(tǒng)性真菌病，一般不應(yīng)用于治療灰指甲。因此，目前臨床上常用于治療灰指甲的口服抗真菌藥物只有特比萘芬與伊曲康唑。

口服抗真菌藥可以用于治療臨床上所有類型的灰指甲，可以應(yīng)用于患有各種全身性疾病的灰指甲患者，如艾滋病、糖尿病、免疫性疾病等。其優(yōu)點是療效好，治愈率可達80%～90%，明顯高于外用涂劑，可應(yīng)用于甲破壞較嚴重，外用涂劑治療無效的病例。

口服抗真菌藥也有很多缺點，因治療灰指甲時抗真菌藥物療程較長，常會導(dǎo)致一定的毒副作用，對身體造成嚴重損害，且藥物價格相對昂貴，會造成沉重的經(jīng)濟負擔。