生殖器皰疹從感染到發(fā)病一般為3-5天，患處先有燒灼感，然后出現(xiàn)紅斑，繼之在紅斑的基礎(chǔ)上發(fā)生多群紅色丘疹，并感到熱癢，不久即可變成小水庖，數(shù)日后水皰變?yōu)槟撔?，破后可形成糜爛，最后可結(jié)痂痊愈。整個病程15-20天。這是生殖器皰疹的主要生殖器皰疹的早期癥狀表現(xiàn)。

男性生殖器皰疹，多生于龜頭、冠狀溝、包皮、陰莖體、尿道口和陰囊。男性同性戀者由于肛交，皰疹可發(fā)生于肛門及肛周，嚴重者可感染直腸。男性同時可并發(fā)尿道炎、膀胱炎和前列腺炎；女性可并發(fā)宮頸炎和子宮炎。大多數(shù)生殖器皰疹患者還可并發(fā)雙側(cè)腹股溝淋巴結(jié)腫大。

最常見的生殖器皰疹的早期癥狀表現(xiàn)是一簇包含有流動性液體的大水皰，破裂后會產(chǎn)生疼痛的潰瘍，潰瘍之后結(jié)痂然后自愈。這個過程可能會持續(xù)好幾天。但是在有些人只表現(xiàn)為皮膚上有一些小疹子和類似丘疹的小腫塊。還有些人有一些其他的癥狀像小便澀痛，在一些女性中可以表現(xiàn)為有陰道液體排出。

女性發(fā)病發(fā)生于大小陰唇、陰蒂或?qū)m頸處，呈現(xiàn)集簇性分布，先為紅色丘疹，可變成小水瘡，皰疹半透明，內(nèi)含黃色液體，抓后極易破潰糜爛，可灼熱疼痛，也可能出現(xiàn)繼發(fā)感染，腹股溝淋巴結(jié)腫大，有壓痛，但多不化膿。本病呈自限性，也就是說可以不治自愈，1-2周自然消退，當機體再次抵抗力下降，就又發(fā)作，如此反復不止，很難根治可診斷為復發(fā)性生殖器皰疹。