生殖器皰疹的HSV感染的潛伏期為1周至2個月。HSV-1感染首要發(fā)生于口角、唇緣、鼻孔等肌膚粘膜交界處，亦可見面子或口唇，開端局部先有灼癢及輕度緊張感，偶有伴發(fā)神經(jīng)痛。隨即呈現(xiàn)紅斑，在紅斑基礎(chǔ)上發(fā)生簇集性小丘疹，迅速變?yōu)樗诹Ｖ辆G豆巨細的水皰，內(nèi)容弄清，水皰破裂后呈現(xiàn)潰爛面，數(shù)日后枯燥結(jié)痂。自覺灼癢，偶有厭倦，不適和輕微發(fā)熱等全身表現(xiàn)，愈合可留傳暫時性色素冷靜。全病程1-2周擺布。

HSV-2感染首要發(fā)生于生殖器部位，患部先有炙烤感，很快在紅斑的基礎(chǔ)上發(fā)生成群的小水皰，多見男性包皮、龜頭、冠狀溝、陰莖等處，偶見于尿道；女人常見于陰唇、陰蒂、陰道、宮頸等處。水皰可逐步成為膿皰，約6天擺布破潰而構(gòu)成潰爛或淺的潰瘍，自覺痛苦。患者可發(fā)生尿道炎，呈現(xiàn)排尿艱難。多數(shù)人有腹股溝淋巴結(jié)腫大痛苦，有的患者可呈現(xiàn)發(fā)熱、肌肉痛及腦膜炎表現(xiàn)。如發(fā)于女人宮頸者可構(gòu)成潰瘍壞死，陰道分泌物增多，可有下腹痛。應(yīng)留意有無宮頸癌發(fā)生。孕期患生殖器皰疹時易致流產(chǎn)、早產(chǎn)或死胎，并易使新生兒感染，發(fā)生新生兒單純皰疹。

本病通常通過3周擺布能夠康復，但常有重復發(fā)生，通常原發(fā)疹后2-5個月內(nèi)復發(fā)，表現(xiàn)較原發(fā)者輕，規(guī)模亦小，局限于生殖器部位，有時僅有1-2個皰疹，病程亦短，自發(fā)病至愈合6-10天。本病也可伴有生殖器以外部位的感染，如口唇、臂部及中樞神經(jīng)系統(tǒng)等。