生殖器皰疹病毒感染是不容易發(fā)現由于早期，通常是在當有明顯的癥狀，發(fā)現開始愈合的疾病的開始，但是這往往是最佳的治療時間延遲。

生殖器皰疹潛伏期大概是不到十天，有一定的靜止時期，隨后的定期穩(wěn)定的復發(fā)。持續(xù)時間較短通常不用藥7天左右也可消退，然后反復發(fā)熱，精神創(chuàng)傷，酗酒，食物及藥物都有可能導致加快復發(fā)時間。

病毒的感染多處發(fā)生在五官皮膚粘膜之間，皮膚就開始感覺到輕微的瘙癢和緊張，但偶爾的神經疼痛。慢慢形成紅斑，丘疹發(fā)生在小群紅斑的基礎上，迅速成為粟粒至綠豆大小的水皰，內容澄清，糜爛面水皰破裂后，幾天后干燥結痂。自覺灼癢，偶有倦怠，不適和輕微發(fā)熱等全身癥狀，可以留下來醫(yī)治暫時性色素沉著。