生殖器皰疹的傳染源是患者及亞臨床無癥狀的帶病毒者，尤其是在患者的生殖器皮膚或粘膜的皰疹內(nèi)含有單純皰疹病毒，可通過性接觸而傳染給配偶或其他性侶，也在同性戀者中互相傳染。有時在口腔或口腔周圍患有皰疹的人，可通過口腔-生殖器性交，使對方傳染生殖器皰疹。因此，不同方式的性行為，也可傳播生殖器皰疹疾病。

由于有感染性的病毒能在潮濕的環(huán)境中存活數(shù)小時，因而單純皰疹也可通過污染物而間接傳播。生殖器皰疹是一種普遍的性疾病，因為生殖器皰疹在潛伏期中也有傳染性，所以會讓人在不知不覺得情形下成為皰疹的的傳播者和受害者。

單純皰疹病毒人類是單純皰疹病毒的唯一天然宿主，患病的病人即是該病的傳染源。由于病毒可以感染人們的皮膚、口腔、鼻、眼、生殖器，因此病人的唾液、皮膚損害處的分泌物、鼻腔分泌物，以及陰道分泌物、糞便中都可能有病毒存在。

生殖器皰疹HSV感染后平均約4～5日，外陰患部先有灼熱感，旋即發(fā)生成群丘疹，可為一簇或多簇，繼之形成水皰。數(shù)日后演變?yōu)槟摪?，破潰后形成糜爛或淺潰瘍，自覺疼痛，最后結(jié)痂自愈，病程約2～3周。原發(fā)性生殖器皰疹，往往伴有全身不適，低熱、頭痛等全身癥狀，局部淋巴結(jié)腫大。

該病常復(fù)發(fā)，復(fù)發(fā)性生殖器皰疹較原發(fā)者輕，損害小，往往無全身癥狀。男性同性戀可出現(xiàn)肛門直腸HSV-2感染，其發(fā)病率僅次于淋球菌所致的肛門直腸炎，臨床表現(xiàn)為肛門直腸疼痛、便秘、分泌物增加和里急后重，肛周可有皰疹性潰瘍，乙狀結(jié)腸鏡檢常見直腸下段粘膜充血、出血和潰瘍。