大多數(shù)原發(fā)性萎縮性鼻炎原因不明，有下列數(shù)種學(xué)說：

1、維生素缺乏學(xué)說維生素A、B、B2治療本病，可收到良好效果，故有此說。近年來人民生活改善，國內(nèi)萎縮性鼻炎發(fā)病率大為降低，僅在某些地區(qū)有較多本病患者。

2、內(nèi)分泌功能紊亂因為本病常發(fā)生于女性青春期，并在月經(jīng)期癥狀加重，可能與性激素分泌紊亂有關(guān)。

3、細(xì)菌感染學(xué)說本病患者鼻分泌物中可培養(yǎng)出類白喉桿菌、臭鼻桿菌、變形桿菌等，故有此學(xué)說。但多數(shù)學(xué)者發(fā)現(xiàn)用這些細(xì)菌接種試驗并不引起本病。

4、遺傳學(xué)說有時發(fā)現(xiàn)一家人同患本病，可能與相同的生活條件和環(huán)境有關(guān)，是否純屬遺傳性疾病，尚缺乏證據(jù)。

5、免疫學(xué)說近年來研究發(fā)現(xiàn)本病患者大多有免疫功能紊亂，故提出本病可能是一種自身免疫病。