糖蛋白抗體在臨床上通常指的是抗β2-糖蛋白1抗體，測定該成分在人體中的水平對輔助診斷抗磷脂抗體綜合征、系統(tǒng)性紅斑狼瘡、類風濕關節(jié)炎、自然流產(chǎn)等現(xiàn)象具有一定價值。

抗β2-糖蛋白1抗體通常在發(fā)生自身免疫性疾病時出現(xiàn)，可作為輔助診斷自身免疫性血栓的標志物。通過檢測該抗體，可判斷患者是否有與該抗體異常有關的疾病。比如抗β2-糖蛋白1抗體高于正常值時，患者出現(xiàn)抗磷脂抗體綜合征、系統(tǒng)性紅斑狼瘡、類風濕關節(jié)炎等疾病的幾率會比較高。同時，β2-糖蛋白1抗體高也是自然流產(chǎn)的病因之一。

患者在出現(xiàn)血管血栓、腦卒中、二尖瓣受累等現(xiàn)象的時候，也可以通過測定抗β2-糖蛋白1抗體進行輔助診斷。