一、慢性扁桃體炎時，隱窩內(nèi)上皮壞死脫落，細(xì)菌及炎性滲出物聚集其中，隱窩可產(chǎn)生小潰瘍及瘢痕形成而引流不暢，適于細(xì)菌生長繁殖，故感染不易消除。屢發(fā)急性扁桃體炎，使機(jī)體抵抗力降低或治療不徹底，則更易轉(zhuǎn)為慢性。本病發(fā)生機(jī)理尚不清楚，但近年來基于免疫學(xué)的觀點(diǎn)，認(rèn)為自身變態(tài)反應(yīng)為引起慢性扁桃體的重要機(jī)制。

二、由于細(xì)菌及分泌物積存于扁桃體窩導(dǎo)致的。