關于皰疹樣皮炎的發(fā)病原因，目前尚未有定論，大多數學者認為該病與患者免疫異常及小腸病變有關。

（1）免疫異常

在患者的皮損和正常皮膚真皮層有免疫物質沉積，在熒光顯微鏡下可見到它們呈顆粒狀。另外，大約70%的患者血中可以找到特殊的抗體及免疫復合物。這些均提示皰疹樣皮炎與患者自身免疫異常有關。

（2）腸病變

約70%～90%的患者有小腸病變，臨床表現為大便溏瀉，做大便常規(guī)檢查，會發(fā)現很多脂肪小顆粒，這說明患者腸功能異常。做組織病理檢查，會看到小腸粘膜的絨毛萎縮變平，粘膜下有淋巴細胞浸潤，如果患者吃了含面筋（學名谷膠，又名麥膠）的食物，如小麥、大麥、燕麥、黑麥，就會使患者皮膚癥狀及腸功能異常加重，假如給予不含面筋的食物，皮損和腸功能異常就會改善。這說明皰疹樣皮炎患者存在對谷膠的敏感性。