通常超聲心動圖檢查都是超聲遇到空氣就被反射，而達不到檢查的目的，經(jīng)胸部檢查就必須避開肺，在有限的肋間部位或胸骨上部位檢查。遇到胸廓畸形等特殊情況使檢查更不方便。另外，超聲波隨著傳導(dǎo)距離遠(yuǎn)而衰減，檢查的效果就會減低，對距離胸壁遠(yuǎn)的心臟結(jié)構(gòu)就不易顯示清楚。

經(jīng)食道超聲檢查是將小型的超聲探頭安置在有一定柔軟性的管桿（類似纖維胃鏡）頭端，經(jīng)食道放入人體，從心臟后面進行檢查為心臟位于食道的前方）。檢查者可以控制使超聲探頭向一定的方向轉(zhuǎn)動，獲取許多切面進行診斷，由于同時有多普勒超聲心動圖功能也可以檢查血流狀況。經(jīng)食道超聲心動圖的優(yōu)點是不受胸廓、肺的影響，能夠清楚顯示遠(yuǎn)離胸壁的心臟結(jié)構(gòu)，適合在心臟手術(shù)時檢查，既不影響手術(shù)操作，還可以檢查手術(shù)的效果。目前多用于心臟手術(shù)過程。經(jīng)食道超聲心動圖的應(yīng)用也是先天性心臟病診斷方面的重要進展。